Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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