Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd4Q8BFT6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd4Q8BFT6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms