Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pnma8aQ80VM8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pnma8aQ80VM8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pnma8aQ80VM8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pnma8aQ80VM8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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