Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcp4l1Q6W8Q3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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