Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cachd1Q6PDJ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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