Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrimpolQ6P1E7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms