Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms