Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HelbQ6NVF4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms