Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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