Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms