Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CochQ62507 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CochQ62507 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms