Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpd52Q62393 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpd52Q62393 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms