Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms