Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms