Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms