Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms