Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HnrnpdQ60668 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms