Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms