Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms