Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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