Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms