Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms