Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc27Q3V036 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc27Q3V036 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms