Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
SvipQ3UZP4 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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