Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms