Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
YrdcQ3U5F4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms