Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms