Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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