Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm1123Q1RME4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gm1123Q1RME4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm1123Q1RME4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms