Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptcd3Q14C51 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms