Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmntd2Q0VET5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmntd2Q0VET5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms