Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms