Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms