Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms