Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms