Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms