Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snai1Q02085 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms