Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd3P97770 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd3P97770 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms