Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcgP82348 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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