Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sycp3P70281 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms