Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plxna3P70208 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plxna3P70208 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plxna3P70208 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plxna3P70208 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plxna3P70208 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plxna3P70208 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plxna3P70208 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms