Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrig1P70193 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms