Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp3P63024 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp3P63024 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms