Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpfP62307 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms