Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd4P58467 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd4P58467 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms