Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmoP56726 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmoP56726 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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