Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms