Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TspoP50637 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TspoP50637 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms