Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LtbrP50284 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms