Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myo1bP46735 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms